Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprkP35822 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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