Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms