Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrbP28704 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms