Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pde6aP27664 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pde6aP27664 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pde6aP27664 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pde6aP27664 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pde6aP27664 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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