Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18524 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms