Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa-rs1P17533 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms