Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms