Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms