Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Calb1P12658 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Calb1P12658 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Calb1P12658 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb1P12658 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb1P12658 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms