Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DmdP11531 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DmdP11531 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms