Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ifna5P07349 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms