Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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