Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms