Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms