Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Dgcr6O35347 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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