Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms