Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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