Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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