Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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