Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Gm20830J3KML6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm20830J3KML6 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm20830J3KML6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm20830J3KML6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20830J3KML6 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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