Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r58G3X9U3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms