Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms