Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms