Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms