Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ddx60E9PZQ1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms