Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samd1D3YXK1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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