Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cttnbp2B9EJA2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms