Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms