Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usf3B2RUQ2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms