Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Brpf1B2RRD7 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brpf1B2RRD7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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