Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rtf1A2AQ19 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rtf1A2AQ19 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rtf1A2AQ19 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.6 ms