Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Syndig1A2ANU3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms