Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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