Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pramef6A2A8M8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pramef6A2A8M8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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