Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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PtprfA2A8L5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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