Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms