Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd3Q9Z2D8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3Q9Z2D8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms