Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cldn8Q9Z260 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cldn8Q9Z260 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn8Q9Z260 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn8Q9Z260 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn8Q9Z260 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn8Q9Z260 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn8Q9Z260 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn8Q9Z260 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn8Q9Z260 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn8Q9Z260 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms