Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psma1Q9R1P4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms