Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Psmb3Q9R1P1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms