Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms