Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

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Length 761 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Phtf1Q9QZ09 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Phtf1Q9QZ09 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Phtf1Q9QZ09 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Phtf1Q9QZ09 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Phtf1Q9QZ09 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Phtf1Q9QZ09 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Phtf1Q9QZ09 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Phtf1Q9QZ09 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Phtf1Q9QZ09 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phtf1Q9QZ09 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms