Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mid2Q9QUS6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mid2Q9QUS6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mid2Q9QUS6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mid2Q9QUS6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mid2Q9QUS6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mid2Q9QUS6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mid2Q9QUS6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mid2Q9QUS6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mid2Q9QUS6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mid2Q9QUS6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mid2Q9QUS6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mid2Q9QUS6 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mid2Q9QUS6 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mid2Q9QUS6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms