Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rabgef1Q9JM13 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rabgef1Q9JM13 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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