Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tmod4Q9JLH8 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tmod4Q9JLH8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmod4Q9JLH8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmod4Q9JLH8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmod4Q9JLH8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmod4Q9JLH8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmod4Q9JLH8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmod4Q9JLH8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmod4Q9JLH8 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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