Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl39Q9JKF7 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms