Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trem1Q9JKE2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms