Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ybx3Q9JKB3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms