Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Rb1cc1Q9ESK9 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Rb1cc1Q9ESK9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rb1cc1Q9ESK9 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rb1cc1Q9ESK9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rb1cc1Q9ESK9 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rb1cc1Q9ESK9 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rb1cc1Q9ESK9 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Rb1cc1Q9ESK9 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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Rb1cc1Q9ESK9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Rb1cc1Q9ESK9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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