Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms